Bioremedijacija se koristi potencijalom mikroorganizama pri uklanjanju onečišćenja iz okoliša. Metabolički putovi kojima se onečišćujuća tvar razgrađuje u manje toksične tvari vrlo su kompleksni. Naprednim tehnikama molekularne biologije mehanizmi bioremedijacije izučavaju se na razini gena. Gen zaslužan za proizvodnju proteina koji razgrađuje onečišćujuću tvar može se izolirati i unijeti u drugi organizam, čime nastaje organizam s poboljšanim bioremedijacijskim svojstvima. Brojna se svjetska istraživanja temelje na genetičkom inženjerstvu na mikroorganizmima, no najveću prepreku upotrebe takvih organizama u bioremedijaciji čine zakonski okviri te nedovoljno poznavanje posljedica njihova oslobađanja u okoliš.; Bioremediation uses the potential of microorganisms for the removal of contaminants from the environment. The metabolic pathways that degrade contaminants into less toxic substances are very complex. Bioremediation mechanisms are studied on the gene level using advanced molecular biology techniques. The gene responsible for the production of a protein that degrades the contaminant can be isolated and introduced into another organism, creating an organism with enhanced bioremediation properties. Scientific research worldwide focuses on genetically engineered microorganisms. However, the greatest obstacle in their application for bioremediation is the legal framework and insufficient knowledge of the consequences of their release into the environment.